藥師咒的意思---藥師如來灌頂真言（藥師咒）
歸依世尊藥師琉璃光如來、應、等正覺，即說咒曰：藥！藥！藥！普遍救度一切眾生，速速成就！
念藥師如來灌頂真言的三大利益
1、親人好友生病痛苦時，可為他們持咒迴向，解除病苦恢復健康。
2、日常多持念藥師咒，可為自己消災解厄，無病延壽，身心自在。
3、臨命終時不恐怖、不痛苦、不墮三惡道，得往生佛國淨土。
藥師如來灌頂真言（藥師咒）
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藥師灌頂真言
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主尊藥師佛
藥師灌頂真言，俗稱藥師咒，是藥師佛的根本真言（陀羅尼），是佛教界普遍誦念的知名咒語。
藥師咒出自於
《藥師琉璃光七佛本願功德經》(大唐三藏法師義淨於佛光內寺 譯)
「復次，曼殊室利！彼藥師琉璃光如來得菩提時，由本願力觀諸有情遇眾病苦，瘦瘧、乾消、黃熱等病，或被厭魅、蠱道所中，或復短命，或時橫死，欲令是等病苦消除，所求願滿。時彼世尊入三摩地，名曰滅除一切眾生苦惱，既入定已，於肉髻中出大光明，光中演說大陀羅尼呪曰： 『南謨薄伽伐帝 鞞殺社寠嚕 薜琉璃鉢喇婆 曷囉闍也 呾他揭多也 阿囉𠿒帝 三藐三勃陀也呾姪他唵 鞞殺逝鞞殺逝 鞞殺社三沒揭帝 莎訶』」
——《藥師琉璃光七佛本願功德經》
咒文
咒文有全咒及心咒兩個版本。在日本流傳的有大咒、中咒、小咒三個版本：當中的大咒即詳版，中咒即簡版，至於小咒，日本學者佐藤任認為其實可能是把《無能勝明王真言》錯當成為本真言，因而出現「小咒」這個版本，因為在其他地方的傳承均沒有「小咒」[1]。
南無薄伽伐帝。鞞殺社。窶嚕薜琉璃。鉢喇婆。喝囉闍也。
怛他揭多也。阿囉喝帝。三藐三勃陀耶。怛姪他。
唵。鞞殺逝。鞞薩逝。鞞薩社。三沒揭帝莎訶。
námó bóqiéfádì, píshāshè, jùlū bìliúlí, bōlǎpó, hèlàshéyě,
dátuōjiēduōyē, ē là hè dì, sānmiǎo sānbótuóyē, dázhítuō,
ān, píshāshì, píshāshì, (mòhè)píshāshè, sānmòjiēdì, suōhē.
namo bhagavate bhaiṣajyaguru vaiḍūryaprabharājāya
tathāgatāya arahate samyaksambuddhāya tadyathā:
oṃ bhaiṣajye bhaiṣajye mahābhaiṣajya-samudgate svāhā.
藏文版本的簡版「藥師心咒」自「tadyathā」開始至「svāhā」結束，但音與梵文有別，漢譯作「喋雅他 嗡 貝勘則 貝勘則 瑪哈貝勘則 喇雜薩目 嘎喋 梭哈」[2]。
藥師咒：
那謨薄伽筏帝，裨殺社窶嚕，薛琉璃缽剌婆喝囉闍也，怛陀揭多耶，阿羅訶帝，三藐三勃陀耶。怛姪阤：唵，鞞殺逝，鞞殺逝，鞞殺社，三沒揭帝娑訶
念藥師咒的三大利益：
一、為他人
親人好友生病難過，可為他持咒，每次持咒108遍，加持在病人的藥物、食物或煮開的水裡給病人服用，可以幫助病人脫離病苦恢復健康。為病人持咒治病，最好能夠先洗澡漱口，保持身口的清淨。
二、為自己
自己生病依前面方法為自己解除疾病。多念藥師咒可以無病延年，常保健康。
三、往生藥師佛淨土
念藥師咒命終可以往生美麗的藥師如來淨土，不會有墮落三惡道的恐怖，也不必再來人間受冷暖之苦。
迴向：
唸「藥師咒」請作如下迴向：
願以此功德供養十方三世諸佛，再以此功德迴向十方三世一切眾生，願眾生離苦得樂，往生佛國淨土證得菩提。再以此功德迴向○○○（自己的名字或患病者的名字）的冤親債主，願他們能離苦得樂，往生佛國淨土，證得菩提。再以此功德迴向○○○（自己或患者），願○○○（自己或患者）業障消除，病症痊癒，身心恢復健康。
藥師佛的大願
藥師佛發了十二個大願幫助一切眾生：
一、藥師佛要幫助所有眾生如祂一般，威相光明、功德巍巍，個個都能修學有成，成就人中至尊─佛陀。
二、藥師佛身相通徹透明，如琉璃一般無瑕清淨，在祂大光明照耀之下，一切眾生皆解脫煩惱痛苦，隨自己意願無事不成。
三、要讓所有的人，需要什麼就得什麼，沒有貧乏，一切稱心如意。
四、走邪路，懷邪心的人，藥師佛轉變其心，讓他心生柔和，能夠利益別人。或只求個人了生死，藥師佛轉化其狹隘心量為大眾發心，由小我而走向大我。
五、聽到藥師佛號一心受持，可得戒行清淨，不墮三惡道。
六、外貌不揚、身體或四肢有缺陷、精神失常、被種種病苦折磨的人，聽了藥師佛號後專心修持，可得其威神力加持，一切都得以救治。
七、貧窮及病痛纏身，稱念藥師如來聖號，一切病痛都可消除，生活物資也能圓滿無缺。
八、女人身心多苦多病，若要捨棄女人身，專心念藥師佛名，來生可轉女相為男相。
九、思想偏激、行為偏差，藥師佛將用種種方法導邪歸正，令其覺悟而起正行修持。
十、犯罪坐牢或遭種種災難身心受苦，稱藥師佛名，以藥師佛的福德威神力可以解脫一切憂苦。
十一、生活困難、為了謀生而造惡，專念藥師如來名號能夠獲得改善，衣食無缺，過著良好的生活。
十二、貧苦的人修藥師法門，一心念藥師佛號，所要求的都能圓滿如願。
藥師佛特別重視生病的、痛苦的、貧窮的人，致力救濟這些人，讓他們身心及環境能轉惡劣為良善。
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藥師灌頂真言（藥師咒）
南無薄伽伐帝 鞞殺社寠魯
ㄋㄢˊ ㄇㄛˊ ㄅㄛˊ ㄑㄧㄝˊ ㄈㄚˊ ㄉㄧˋ ㄆㄧˊ ㄕㄚ ㄕㄜˋ ㄐㄩˋ ㄌㄨˇ
辟琉璃 缽喇婆 喝囉闍也
ㄆㄧˋ ㄌㄧㄡˊ ㄌㄧˊ ㄅㄛ ㄌㄚˋ ㄆㄛˊ ㄏㄜ ㄌㄚˋ ㄕㄜˊ ㄧㄝˇ
怛他揭多耶
ㄉㄚˊ ㄊㄚ ㄐㄧㄝ ㄉㄨㄛ ㄧㄝ
阿囉喝帝 三藐三勃陀耶 怛姪他
ㄚ ㄌㄚˋ ㄏㄜ ㄉㄧˋ ㄙㄢ ㄇㄧㄠˇ ㄙㄢ ㄅㄛˊ ㄊㄨㄛˊ ㄧㄝ ㄉㄚˊ ㄓˊ ㄊㄚ
唵 鞞殺逝 鞞殺逝 鞞殺社
ㄢˇ ㄆㄧˊ ㄕㄚ ㄕˋ ㄆㄧˊ ㄕㄚ ㄕˋ ㄆㄧˊ ㄕㄚ ㄕㄜˋ
三沒揭諦莎訶
ㄙㄢ ㄇㄛˋ ㄐㄧㄝ ㄉㄧˋ ㄙㄨㄛ ㄏㄜ
藥師琉璃光如來十二大願：
第一大願：(正報莊嚴)
願我來世，得阿耨多羅三藐三菩提時，自身光明熾然照耀無量無盡無邊世界，以三十二大丈夫相，八十隨形莊嚴其身；令一切有情如我無異。
第二大願：(身光破暗)
願我來世得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢；光明廣大，功德巍巍，身善安住，燄網莊嚴過於日月；幽冥眾生，悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事。
第三大願：(智慧資生)
願我來世得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸有情皆得無盡所受用物，莫令眾生，有所乏少。
第四大願：(導入大乘)
願我來世得菩提時，若諸有情行邪道者，悉令安住菩提道中；苦行聲聞獨覺乘者，皆以大乘而安立。
第五大願：(得戒清淨)
願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒、具三聚戒；設有毀犯，聞我名已還得清淨，不墮惡趣。
第六大願：(得身健美)
願我來世得菩提時，若諸有情，其身下劣，諸根不具，醜陋、頑愚、盲、聾、瘖、啞、攣躄、背僂、白癩、顛狂、種種病苦；聞我名已，一切皆得端正黠慧，諸根完具，無諸疾苦。
第七大願：(安康樂道)
願我來世得菩提時，若諸有情眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦；我之名號一經其耳，眾病悉除，身心安樂，家屬資具悉皆豐足，乃至證得無上菩提。
第八大願：(轉女成男)
願我來世得菩提時，若有女人為女百惡之所逼惱，極生厭離，願捨女身；聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上菩提。
第九大願：(魔外歸正)
願我來世得菩提時，令諸有情出魔罥網，解脫一切外道纏縛；若墮種種惡見稠林，皆當引攝置於正見，漸令修習諸菩薩行，速證無上正等菩提。
第十大願：(解脫憂苦)
願我來世得菩提時，若諸有情王法所加，縛錄鞭撻，繫閉牢獄，或當刑戮，及餘無量災難凌辱，悲愁煎逼，身心受苦；若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦。
第十一大願：(得妙飲食)
願我來世得菩提時，若諸有情饑渴所惱，為求食故造諸惡業；得聞我名，專念受持，我當先以上妙飲食飽足其身，後以法味畢竟安樂而建立之。
第十二大願：(得妙衣服)
願我來世得菩提時，若諸有情貧無衣服，蚊虻寒熱，晝夜逼惱；若聞我名，專念受持，如其所好即得種種上妙衣服，亦得一切寶莊嚴具，華鬘、塗香，鼓樂眾伎，隨心所翫，皆令滿足。
持誦藥師咒的利益
一、利他：
親人好友生病難過，可為他持咒，每次持咒108遍，加持在病人的藥物、食物或煮開的水裡給病人服用，可以幫助病人脫離病苦恢復健康。為病人持咒治病，最好能夠先洗澡漱口，保持身口的清淨。
二、自利：
自己生病依前面方法為自己解除疾病。多念藥師咒可以無病延年，常保健康。
三、往生藥師佛淨土：
念藥師咒命終可以往生美麗的藥師如來淨土，不會有墮落三惡道的恐怖，也不必再來人間受冷暖之苦。
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初入藥師佛法門，如同蓋房打地基。地基就如同一個人的根器，如果他的業很重，應先消業障，持三個字或五個字的短咒，咒語很短，易持，就不會起退道心，這樣把業消一消，心定下來，才有辦法把經讀下去。初學佛的人，如果馬上要他持誦很長的經典，他或許就沒有這樣的耐心，你要度他，一定先要讓他知道佛法的好處，只要持一個短短的咒語，馬上止痛，讓他感受到佛法的妙用，有了基礎後，再下重藥，這時才給他持一經、一咒、一佛號，直入藥師法門。
•一經一咒一佛號是指：
以藥師法門來說，經是藥師琉璃光如來本願功德經，咒就是藥師經中的大咒、中咒和小咒。佛號就是持念“南無藥師琉璃光如來”聖號，百遍、千遍乃至萬遍。
•誦經和持咒的不同點：
經如同中藥，經典裡的開示如同中藥成分，知道中藥很好，但是需要時間去炖、炖好服用，慢慢調養，有一天身體就會好起來。咒語是翻音不翻義，但咒就像特效藥，可以達到快速消除痛苦的效果。延伸的說，經就像一條大路，咒語就是路旁的指示牌，不同的經，不同的路，不同的咒語，不同的指示方向。
•初學者先持咒後誦經，這是一個方法：
如果一個人在貧病中，各方面條件不俱足，你要給他持咒，先達到止痛的效果，等到他不痛了，才有辦法持誦經典。如果是一般人，亦可以從經入門，知道路怎麼走，再持咒，那就是所謂的中藥和特效藥。所以要分兩個階段來說。
咒語因人而異：
咒語因人而異，視個人的根器而定，但不論是什麼咒語，只要是佛菩薩的咒語，都是真實語。但各別佛菩薩發的願力不一樣，如同一間醫院裡有不同的專科醫生。同樣的，不同的咒語有不同的功能。如同不同的專科功能。例如脾氣不好的人，忍辱不夠，相對的，在人、事、物處理方面有所缺乏，這時你要給他一個開啟智慧的咒語，固執不易相處的人，你要給他持心經、金剛咒乃至觀自在菩薩的咒語等。
•藥師法門裡，大咒、中咒、小咒是指：
大咒又稱大解結咒，（十二藥叉大將名就是大解結咒）。
中咒是藥師灌頂真言。
小咒是咒心：鞞殺逝、鞞殺逝、鞞殺社、三沒揭帝、娑哈。
•一般人如何持念：
如果身、口、意都非常忙碌的人，不要持太長的大咒，大咒可能會念不下去，可先持藥師灌頂真言。如果學佛的時間比較久，有基本禅定功夫，大咒、中咒或小咒都沒有問題。
長咒和短咒的效果相同：
都是一樣的，分別是大咒、中咒比較長，念的次數減少，小咒比較短，次數要多。長咒和短咒的分別是長咒比較不容易專心，如果沒有基本功夫，或有散漫心，也許念到一半，又起雜亂心，這時可以先念短咒，能夠專注後再念長咒。
•看電視時可以持咒，效果跟一心不亂中持咒比起來差多了：
可以，但是這是屬於和藥師佛結緣方式在念，以妄想心、散亂心、煩惱心下持咒，像看電視、聽音樂、談話時持咒有如稻米，空有殼沒有米。但有結緣上的功德。
兩者有差別。一心不亂中持咒，即使僅有十分鐘有時比一整天持咒的總和還要來的殊勝。不管是散亂心還是一心不亂的念佛持咒都是要念，因為這樣可以培養在在處處都會想到念佛持咒的習慣，那麼在我們臨終時不管任何吵雜的環境，仍然可以一心不亂念佛求往生。
•藥師咒在什麼場所不可念：
在浴室，廁所時不可出聲念，可默念。夫妻同房時勿念。
•一個生病的人要持多少遍的藥師咒，如何持：
持之以恆，持咒當下，一天固定地念，要至誠地持誦。
可念“南無藥師琉璃光如來”三次。
念大咒“宮毗羅、伐折羅、迷企羅、安底羅、額儞羅、珊底羅、因達羅、波夷羅、摩虎羅、真達羅、招杜羅、毗羯羅，娑哈（soha）。”
若有病苦者應多加持念“唵、室哩哆、室哩哆、軍剎利、娑哈（soha）”。
或者持念“唵、虎噜虎噜、戰奴裡、摩登奇、娑哈（soha）”。
也可再持念藥師佛心咒“唵、鞞殺逝、鞞殺逝、鞞殺社、三沒揭帝娑哈（soha）”。
念畢回向：持咒功德回向（某人）冤親債主、離苦得樂、解冤釋結，又願（某人求某願）（1次）
每種咒語每日至少持念108遍，長期受持，可消災解厄，所願從心。假使能在持咒前先讀誦南無藥師琉璃光如來本願功德經一遍，更是理想，你如果可以這樣子持之以恆，長期受持，那麼你一生所遇到的障礙將是相對的減少，所到之處長逢善緣。
•藥師咒水：
每天早上和臨睡前，置一杯水於藥師佛像前，或在杯前放一張藥師佛相，至誠心的持誦七遍藥師灌頂真言，再持藥師咒心：唵、鞞殺逝、鞞殺逝、鞞殺社、三沒揭帝娑哈（soha）108遍。可配合觀想，觀想藥師佛光從頂門而入，遍滿全身，汗水由手而出，發出黑色的汗水為止，亦可觀想藥師佛手上的佛果，祈求藥師佛慈悲施藥，藥師咒水既完成。
每天早晚持藥師咒水口服，祈求南無藥師琉璃光如來加被，冤親債主離苦得樂，疾病遠離。（藥師佛在在處處，如無佛像可一心一意念佛祈求藥師佛加被。）
•何謂冤親債主：
什麼叫「冤」；什麼叫「親」？你的「親」處理不好就變成「冤」，所以稱為「冤親債主」。今天愛你，明天恨你，在你身邊的，有「親」也有「冤」，有貴人幫助你，當你遇到困境的時候「冤」也會找你的麻煩。
•如何對待我們的冤親債主：
要回向給他們。幫助我們的，要感謝他，對我們不好的，也要感恩他，在我們修行的過程中，要常發願祈求冤親平等。
•佛菩薩不是只幫助好人，如果是一個公認的壞人，藥師佛也幫他：
但首先他要有忏悔的心，藥師佛是非常慈悲的，即使他沒有忏悔的心，如果他有布施的心，藥師佛還是會給他機會，在具備佈施心中求富饒，求來的財富一定要拿出若干佈施救濟貧困，這就是以福培福再造福。如果沒有如此的慈悲喜捨，即使延壽三年、五年還是要走，財來也會財去。
•以科學的觀點，生病是由於生理不調導致疾病的產生，以佛教的角度，如何看待疾病：
以佛教的角度，這是業力的牽引，什麼是業力，簡單的說，行為造作所產生的結果，比如一個人脾氣很壞，就會導致他有心髒病、高血壓、乃至血液循環不好，延續到骨頭酸痛，這就是因果，也叫做業力。所以奉勸大家脾氣不要太壞。
•病者修持藥師法門，除了誦經持咒以外，還要配合其他的善行：
修持藥師法門，除了經咒以外，最好還要加上點燈、放生和佈施三種善行。
點燈就如同暗室之中，一燈即明。在佛教中點燈供佛有很大的功德，以此功德回向如同在黑暗中一盞明燈在指引前進，走向光明大道。
除此以外，還要配合放生，放生的意義就是解脫其他生物的壽命，免除災難，使其延壽。
提到放生，這裡要強調放生要得宜，鹹水魚不要放到淡水處及不固定地點購買，以免商家大量采購，而失去放生的意義。
至於佈施，就是盡所能――盡你的能力佈施，因為有捨才有得，福從佈施中來，盡所能的修福，有福就會有壽。
•點燈要如何點：
可點一燈、七燈、二十一燈、三十五燈、四十九燈乃至一百零八盞藥師延壽燈。
•要點多少天：
最少七天，最多四十九天。如果需要可以長期在佛堂供一盞藥師平安燈。
•每次誦經持咒後誓必要做回向：
把誦經持咒的功課做完，一天結束，就可以做回向，為什麼要做回向，誦經持咒功德，就如同戶口累積儲蓄，回向就如同該還的還給人家，要做佈施的佈施出去。
•如何避免九種橫死？要持何種咒語降服？
藥師經云：燃燈、造旙、放生、修福令度苦厄不遭眾難。南無藥師琉璃光如來本願功德經，亦名說十二神將饒益有情結願神咒，亦名拔除一切業障。十二藥叉大將在聽聞佛陀宣說藥師經時，曾發願若有人流佈此經或復受持藥師琉璃光名號恭敬供養者，十二藥叉各有七千眷屬皆同衛護是人皆使解脫一切苦難。因此要避免九種橫死可持十二藥叉大將名號的大解結咒，（十二藥叉大將去除大將稱謂就是大解結咒）。大解結咒有此護法威力，平時多加持念，可免九種橫死。
如果你已經苦了幾十年，現在有一種這麼好的方法，只要每天持之以恆，勤念一百零八遍起，每天累積，至二十一萬、三十五萬、一百零八萬乃至五百萬遍，那麼你的前景是美麗的。為什麼不去實行呢？
也許你目前沒有碰到困境，但人生路並非都是平坦的，平時也要多加持念、回向。
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藥師佛聖號
藥師佛聖號據《藥師琉璃光如來本願功德經》載為「藥師琉璃光如來」，梵文音譯為「鞞殺社(藥)窶嚕(師) 薜琉璃(琉璃) 跋喇婆(光) 喝囉闍也(王)」（Bhaiṣajya-guru-vaiḍūrya-prabhā-rāja），故完整稱號宜為「藥師琉璃光王如來」，然現在普遍省略「王」字，稱念「南無藥師琉璃光如來」或「南無藥師琉璃光佛」。 梵文、漢文、藏文《藥師經》皆多稱作「藥師琉璃光如來」，漢文、藏文（目前未見梵文本）的《藥師七佛經》，亦以「藥師琉璃光如來」為主。另漢傳佛教也稱之為「消災延壽藥師佛」、「大醫藥王佛」。
藥師咒
藥師灌頂真言
南無薄伽伐帝，鞞殺社窶嚕，薜琉璃，跋喇婆, 喝囉闍也，怛他揭多也，阿囉訶帝，三藐三勃陀耶，怛侄他，唵，鞞剎逝，鞞剎逝，鞞剎社，三慕揭帝，娑婆訶！
Namo bhagavate bhaiṣajya guru vaiḍūrya prabhā rājāya tathāgatāya arhate samyaksaṃbuddhāya. 皈命___世尊_____藥______師__琉璃_____光____王______如來__應供_____正等覺
Tadyathā, Oṃ bhaiṣajye bhaiṣajye bhaiṣajya samudgate svāhā! 即說咒曰：嗡____藥在____藥在____藥____發生效力_____圓滿成就 ！
藥師咒一在生病、受傷時誦念，祈求藥師佛加持病人，幫助早日療癒（於食物或飲水誦念一百零八遍，給病人服用）；二是與藥師佛相應，能夠往生藥師佛的佛國淨琉璃世界，也可為亡靈誦念。
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藥師佛（梵語：भैषज्यगुरु，Bhaiṣajyaguru），全名作藥師琉璃光（王）佛或藥師琉璃光（王）如來（Bhaiṣajya-guru-vaiḍūrya-prabhā-rāja）。其中的「王」字對應於梵文「rāja」，但譯經與稱名多省略；」琉」與「瑠」字皆有用例。亦俗稱消災延壽藥師佛、大醫藥王佛。經中記載，藥師佛通身透徹、藍色如琉璃，清淨無染出柔光，故以「琉璃光」爲功德名號；其成就和主管的淨琉璃世界亦處處是琉璃淨光。
我們的世界以東另有一佛國曰「妙喜世界」，佛號阿閦佛（不動如來），其佛身色亦為藍色，但非透明。西方阿彌陀佛、此方釋迦牟尼佛、東方藥師佛合稱「橫三世佛」。修持藥師佛法門可往生此處淨土世界，故藥師佛信仰和阿閦佛、阿彌陀佛乃至彌勒菩薩都算「淨土法門」。
在淨琉璃世界，日光遍照菩薩[1]和月光遍照菩薩[2]是藥師佛的兩大脅侍，待藥師佛佛滅後，二菩薩次補佛位，佛教尊稱藥師佛、日光遍照菩薩和月光遍照菩薩為東方三聖。
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